37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4379 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  100 
 
 
74 aa  146  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  62.5 
 
 
74 aa  92  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  45.45 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  39.39 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  50 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  42.42 
 
 
75 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  46.97 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  46.97 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  45.45 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  45.45 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  36.92 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  36.92 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  40.91 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  46.97 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  40.62 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  33.33 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  41.27 
 
 
74 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  43.86 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  37.5 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  31.82 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  44.07 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  36.07 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  35.94 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  36.23 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  31.82 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  40 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  37.5 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  36.11 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  35.62 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  35 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  31.67 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  35.62 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  36.21 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  35.94 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  39.06 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1233  hypothetical protein  33.87 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0780039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  30.16 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>