53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2005 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  100 
 
 		 74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  54.79 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  48.65 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  50.72 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  43.06 
 
 		 73 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  45.83 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  41.67 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  41.67 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  43.66 
 
 		 74 aa  67  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  45.21 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  38.03 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  38.03 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  44.59 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  41.67 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  41.67 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  43.84 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  48.61 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  42.47 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  41.67 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  38.1 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  41.56 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  40.28 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  30.43 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1233  hypothetical protein  36.99 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0780039 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  51.79 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  35.62 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  31.88 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0161  YcfA family protein  32.88 
 
 		 81 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  41.27 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  34.72 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  32.89 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  36.11 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  27.78 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  35.82 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0701  YcfA family protein  33.33 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00509047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  43.1 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  35.29 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  37.68 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  43.33 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  37.93 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0631  YcfA family protein  43.33 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0378293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  34.43 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  41.67 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  34.72 
 
 		 79 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  34.72 
 
 		 79 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4059  YcfA family protein  45.76 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1007  YcfA family protein  36.36 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.29873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>