36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2779 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  100 
 
 		 76 aa  153  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  43.84 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  45.83 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  39.73 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  36.99 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  36.99 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  36.99 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  34.25 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  34.25 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  42.67 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  40.28 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  31.51 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  38.36 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  41.89 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  39.39 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  30 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  30 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  40.28 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  38.81 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  34.25 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  36 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  32.88 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  33.33 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  33.33 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  27.4 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  36 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  28.77 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  35.94 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  32.86 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1233  hypothetical protein  29.73 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0780039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  32.35 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  33.85 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>