50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1100 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  100 
 
 		 73 aa  146  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  64.79 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  52.78 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  50.68 
 
 		 73 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  50.68 
 
 		 73 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  46.58 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  51.39 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  51.39 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  44.59 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  40.85 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  40.85 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  40.28 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  42.47 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  44.59 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  40 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  42.65 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  42.67 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  40.58 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  32.39 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  49.35 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  39.44 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  41.67 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  41.67 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  41.89 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  40.54 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  42.25 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  39.73 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  39.74 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  38.57 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  35.62 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  35.62 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  41.18 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  39.68 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  38.57 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  33.33 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  40 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  33.8 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0355  hypothetical protein  42.67 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  40 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1233  hypothetical protein  32.88 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0780039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  37.84 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  44.29 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  40 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  41.94 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  37.14 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  42.62 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  42.62 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  41.51 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>