40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1471 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  100 
 
 		 76 aa  155  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  95.08 
 
 		 67 aa  120  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  49.35 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  47.22 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  45.45 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  45.71 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  50 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  41.18 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  38.89 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  45.71 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  40 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  36 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0444  YcfA family protein  52.38 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0267733 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  36 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  40.58 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  40.58 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  35.62 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  37.33 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  39.68 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  40.79 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  38.57 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  40.79 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  35.53 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  35.14 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  36.99 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  37.84 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  37.33 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  37.84 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  37.33 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  35.71 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  28.77 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  31.51 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  33.8 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  39.34 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  39.34 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  40.98 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  34.18 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  35.21 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  31.65 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  42.86 
 
 		 62 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>