26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2649 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  100 
 
 
81 aa  166  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  45.59 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  50 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  43.66 
 
 
74 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  50.85 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  46.77 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  42.19 
 
 
77 aa  52  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  45.76 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  44.29 
 
 
73 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  44.29 
 
 
73 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  39.29 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  36.84 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  39.29 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  36.62 
 
 
74 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  36.62 
 
 
74 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  41.18 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  40.58 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  38.03 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3110  hypothetical protein  35.82 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187609  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  35.29 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  31.51 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  38.24 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  38.24 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  39.66 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  34.29 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  39.44 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>