17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0980 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  100 
 
 
77 aa  156  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  49.35 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  51.95 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  41.56 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  52.38 
 
 
67 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  44.93 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  38.57 
 
 
80 aa  60.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  37.66 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  43.28 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  42.19 
 
 
81 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  36.92 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  43.28 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1678  YcfA family protein  42.19 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.830575  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1660  YcfA family protein  42.19 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  36 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  36 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  34.21 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>