34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0621 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  100 
 
 
76 aa  154  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  61.04 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  51.95 
 
 
77 aa  78.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  47.22 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  45.33 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  42.47 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  50 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  49.25 
 
 
74 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  47.83 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  38.89 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  38.89 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  45.76 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  39.44 
 
 
73 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  40.58 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  40.58 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  32.88 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  32.88 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  41.54 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  35.14 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  33.33 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0444  YcfA family protein  41.07 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0267733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  36.62 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  33.33 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  35 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  33.33 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  32.2 
 
 
60 aa  42.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  36.11 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  34.72 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  32.35 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  35.62 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  36.11 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  39.06 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  35.71 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  31.08 
 
 
78 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>