41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2121 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  159  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  41.67 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  42.47 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  41.18 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  37.66 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  40.28 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  32.05 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  41.18 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  46.77 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  38.67 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  36 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  36 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  42.65 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  46 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  34.67 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  31.88 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  37.33 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  29.33 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  43.24 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  29.33 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  37.66 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  37.66 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0848  YcfA family protein  36.23 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  32.88 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  36 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  34.43 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  38.33 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  35 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  33.78 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  33.78 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  36.76 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  32.31 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  33.96 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  36.23 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  30.14 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  38.18 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  30.14 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0444  YcfA family protein  44.19 
 
 		 60 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0267733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  31.58 
 
 		 76 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  30.26 
 
 		 74 aa  40.8  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  29.49 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>