39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3343 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  100 
 
 		 62 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  58.06 
 
 		 63 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0047  YcfA family protein  54.84 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000425869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4059  YcfA family protein  57.63 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  52.54 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  52.54 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  52.73 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  44.83 
 
 		 59 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  43.1 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  44.07 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  51.79 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  45.61 
 
 		 60 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  45.76 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  50.91 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  43.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  42.11 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  46.55 
 
 		 60 aa  47.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  44.83 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  47.46 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  47.37 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  58.14 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  38.6 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  42.11 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  44.83 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  45.61 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  38.6 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  45.61 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  39.66 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  41.38 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  40.35 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  41.38 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  41.38 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  38.18 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  44.83 
 
 		 60 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  40.35 
 
 		 64 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  43.86 
 
 		 64 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  40.35 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  42.11 
 
 		 60 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>