37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1951 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  100 
 
 
74 aa  156  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  98.65 
 
 
74 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  63.01 
 
 
76 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  41.67 
 
 
73 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  41.67 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  36.99 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  36.99 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  39.44 
 
 
78 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  37.84 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  43.86 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  39.19 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  36.92 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  37.68 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  36.92 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1007  YcfA family protein  37.68 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.29873  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  37.33 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  35.14 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  38.89 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0596  YcfA family protein  36.92 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.548291  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  44.83 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  33.33 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  33.33 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  39.34 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1099  YcfA family protein  44.68 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.718032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  33.78 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  38.6 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  42.59 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  40.28 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  33.9 
 
 
60 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  33.87 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  36.84 
 
 
59 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  40.68 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  36.84 
 
 
59 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  40 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  37.7 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0137  YcfA family protein  36.51 
 
 
69 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.010753  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  38.6 
 
 
84 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>