41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5956 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  100 
 
 		 74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  94.52 
 
 		 75 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  53.33 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  50.72 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  48.61 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  42.25 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  42.25 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  45.07 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  38.36 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  42.47 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  38.36 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  38.36 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  42.67 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  36.99 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  36.99 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  35.62 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  35.62 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  37.33 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  52.73 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  43.48 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  31.51 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  41.79 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  41.79 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  41.1 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1099  YcfA family protein  52.08 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.718032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  37.84 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  36.49 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  39.44 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  29.23 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  34.29 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  38.57 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  38.6 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  32.31 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  35.53 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  38.33 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  36.92 
 
 		 74 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4059  YcfA family protein  34.43 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  35 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  35.94 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  32.39 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>