35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4059 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4059  YcfA family protein  100 
 
 		 65 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0047  YcfA family protein  66.1 
 
 		 66 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000425869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  61.02 
 
 		 63 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  57.63 
 
 		 62 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  47.37 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  45.61 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  47.37 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  47.54 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  46 
 
 		 54 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  44.64 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  43.86 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  45.61 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  48.21 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  42.11 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  47.62 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  42.37 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  43.1 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  46.43 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0559  YcfA family protein  47.27 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.879901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  39.29 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  38.6 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  42.11 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  40.35 
 
 		 59 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  45.61 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  39.06 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  41.07 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  35 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  36.84 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  45.76 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  49.02 
 
 		 65 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1471  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000207529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  34.43 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  38.6 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  37.1 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>