55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1634 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  67.8 
 
 		 71 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  67.8 
 
 		 59 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  64.41 
 
 		 59 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  64.41 
 
 		 59 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  59.32 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  55 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  55 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  58.93 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  56.14 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  54.24 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  52.54 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  59.65 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  60 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  54.24 
 
 		 60 aa  67  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  55.93 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  54.24 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  49.15 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  54.39 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  49.15 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  50.85 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  52.54 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  55 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  49.12 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  50 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  48.28 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  56.52 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  49.15 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  52.63 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0047  YcfA family protein  46.43 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000425869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  37.7 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  37.7 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  43.33 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4059  YcfA family protein  43.86 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  44.26 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  44.26 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  38.71 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  37.93 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  44.26 
 
 		 62 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  43.33 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0586  YcfA-like  38.33 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143835  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  45.61 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  38.33 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  44.07 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  40 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  36.67 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3438  YcfA family protein  31.75 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0971  hypothetical protein  31.75 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3307  hypothetical protein  31.75 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0601  YcfA family protein  43.14 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1099  YcfA family protein  48.84 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.718032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2607  YcfA family protein  34.48 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487609  normal  0.228083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>