51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6578 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  100 
 
 		 64 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  64.41 
 
 		 59 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  62.71 
 
 		 59 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  64.41 
 
 		 59 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  59.38 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  52.46 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  55.74 
 
 		 62 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  55 
 
 		 61 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  55 
 
 		 60 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  59.65 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  55 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  57.38 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  52.54 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  56.9 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  50.85 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  55.93 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  56.14 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  50.85 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  58.33 
 
 		 54 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  52.54 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  50.85 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  50.85 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  50.85 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  48.33 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  48.21 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  47.46 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  52.54 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  45.9 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0047  YcfA family protein  47.37 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000425869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  40.68 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  43.33 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  43.33 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  41.67 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  46.03 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  44.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  43.33 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  43.33 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2607  YcfA family protein  41.38 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487609  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  41.38 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4059  YcfA family protein  42.11 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  43.86 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  43.1 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0586  YcfA-like  42.37 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143835  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0601  YcfA family protein  43.14 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  29.51 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0137  YcfA family protein  38.6 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.010753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4922  YcfA family protein  44.19 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.012764  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3438  YcfA family protein  31.82 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3307  hypothetical protein  31.82 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  36.67 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0971  hypothetical protein  31.82 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>