43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2546 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  100 
 
 		 60 aa  123  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  66.1 
 
 		 60 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  66.07 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  61.67 
 
 		 61 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  57.63 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  55 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  54.24 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  50.85 
 
 		 59 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  50.85 
 
 		 59 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  54.24 
 
 		 59 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  48.33 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  55.93 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  52.54 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  44.07 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  44.07 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  45.76 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  50.88 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  47.37 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3307  hypothetical protein  46.03 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0971  hypothetical protein  46.03 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3438  YcfA family protein  46.03 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  45 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  45.76 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  42.37 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  40.35 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  43.33 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  38.33 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  39.06 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  39.06 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  41.3 
 
 		 54 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  38.33 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  38.33 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  42.86 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  37.93 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  36.67 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  35.48 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  40.68 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  40.32 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  38.33 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  35.09 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  33.9 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0848  YcfA family protein  33.9 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.230589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>