29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_A0043 on replicon NC_011351
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  123  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  63.33 
 
 		 60 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  55 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  51.67 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  50 
 
 		 59 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  50 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  43.33 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  48.33 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  45 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  36.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  45 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  45 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  45 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  45 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1007  YcfA family protein  38.71 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.29873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  45 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4129  YcfA-like  57.14 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0904081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  45 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  46.55 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1810  YcfA family protein  39.29 
 
 		 65 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0742  YcfA family protein  37.7 
 
 		 64 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.837375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  44.83 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  43.33 
 
 		 59 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  41.67 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0047  YcfA family protein  38.6 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000425869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  39.66 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1413  hypothetical protein  39.29 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000113002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0973  YcfA-like  43.14 
 
 		 65 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254811  hitchhiker  0.00147891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4826  YcfA family protein  43.1 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>