13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4129 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4129  YcfA-like  100 
 
 		 65 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0904081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0973  YcfA-like  95.38 
 
 		 65 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254811  hitchhiker  0.00147891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2635  YcfA family protein  61.54 
 
 		 65 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0742  YcfA family protein  62.9 
 
 		 64 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.837375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1810  YcfA family protein  60 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4826  YcfA family protein  64.91 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4143  YcfA-like  58.06 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.166657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0452  hypothetical protein  53.23 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0486055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1413  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000113002  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  56.76 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  38.71 
 
 		 76 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3661  YcfA family protein  38.33 
 
 		 74 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>