35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1322 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  100 
 
 		 76 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  63.01 
 
 		 74 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  63.01 
 
 		 74 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  39.44 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1007  YcfA family protein  40 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.29873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  50.91 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0596  YcfA family protein  37.14 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.548291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  36.84 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  38.89 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  36.84 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  48.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  37.93 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1099  YcfA family protein  42.55 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.718032  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  40.35 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  36.67 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3661  YcfA family protein  39.73 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  36.49 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  34.78 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  37.5 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  37.5 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  37.66 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  34.72 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  34.72 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  40.98 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  45.76 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  35 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  43.1 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  37.88 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1810  YcfA family protein  39.29 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  33.85 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  40.35 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4129  YcfA-like  38.71 
 
 		 65 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0904081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>