12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1810 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1810  YcfA family protein  100 
 
 		 65 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2635  YcfA family protein  69.23 
 
 		 65 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0742  YcfA family protein  71.43 
 
 		 64 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.837375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4826  YcfA family protein  66.67 
 
 		 64 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4143  YcfA-like  63.49 
 
 		 64 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.166657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4129  YcfA-like  60 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0904081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0973  YcfA-like  56.92 
 
 		 65 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254811  hitchhiker  0.00147891 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0452  hypothetical protein  59.65 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0486055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1413  hypothetical protein  49.23 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000113002  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  48.21 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  39.29 
 
 		 60 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  39.29 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>