51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0136 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  85 
 
 		 60 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  55.93 
 
 		 59 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  61.02 
 
 		 59 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  59.32 
 
 		 59 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  55 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  53.33 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  55.17 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  51.72 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  51.67 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  54.1 
 
 		 71 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  52.54 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  52.54 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  46.55 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  50.85 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  52.54 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  48.28 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  47.46 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  49.15 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  52.46 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  43.33 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  47.37 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  60 
 
 		 54 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  48.33 
 
 		 84 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  44.83 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  47.46 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  50.82 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  47.46 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  48.33 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  50.82 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  45.9 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  45.76 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0601  YcfA family protein  49.06 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0586  YcfA-like  47.54 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143835  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  40.98 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  41.67 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  41.67 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  41.38 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4922  YcfA family protein  43.4 
 
 		 56 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.012764  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  41.07 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  42.11 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  37.5 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0047  YcfA family protein  39.29 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000425869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4059  YcfA family protein  39.29 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  45 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  36.67 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  35 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0137  YcfA family protein  33.33 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.010753  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  40.35 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  39.66 
 
 		 75 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>