27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4922 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4922  YcfA family protein  100 
 
 		 56 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.012764  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  67.92 
 
 		 71 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  66.04 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  58.49 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0586  YcfA-like  64.15 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143835  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  56.6 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0601  YcfA family protein  66.67 
 
 		 56 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  54.35 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  53.06 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  47.17 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  47.17 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  43.4 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  45.45 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  68.57 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  41.51 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  41.51 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  46.81 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  44.9 
 
 		 73 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  48.89 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  47.73 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  38.78 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  47.73 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  48 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  48 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  44.19 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>