36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0586 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0586  YcfA-like  100 
 
 		 64 aa  134  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143835  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  67.21 
 
 		 64 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  67.74 
 
 		 71 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  60.66 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  66.13 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  55.74 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  53.45 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  53.45 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0601  YcfA family protein  62.5 
 
 		 56 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4922  YcfA family protein  64.15 
 
 		 56 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.012764  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  52.46 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  52.38 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  47.54 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  44.26 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  50.79 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  50.85 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  47.54 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  48.28 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  47.54 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  60.87 
 
 		 54 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  50.85 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  49.15 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  46.67 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  49.15 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  45.61 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  42.86 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  46.55 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  40.68 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  42.37 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  42.62 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  38.33 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  41.94 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2607  YcfA family protein  44.44 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487609  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  36.21 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  38.98 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>