27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2607 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2607  YcfA family protein  100 
 
 		 67 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487609  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0137  YcfA family protein  56.25 
 
 		 69 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.010753  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  51.61 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  55.17 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  57.5 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  49.18 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  41.38 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  39.66 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  39.66 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  41.38 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  44.07 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  46 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  46.55 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  39.34 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  46.77 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  39.66 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  45.16 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  37.7 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0586  YcfA-like  44.44 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143835  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  37.7 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  40.68 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  36.84 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  42.86 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  34.48 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  32.81 
 
 		 65 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>