45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1451 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  100 
 
 		 65 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  66.15 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  56.92 
 
 		 65 aa  84.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  56.9 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  54.1 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  54.39 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  56.9 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  57.89 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  57.89 
 
 		 59 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  52.54 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  51.67 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  50 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  50.85 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  44.26 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  47.37 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  53.45 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  48.28 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  43.86 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  54.35 
 
 		 54 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  49.12 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  48.33 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  42.11 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  51.72 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  50 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  40.35 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  41.38 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0586  YcfA-like  42.86 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143835  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  42.11 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2486  YcfA family protein  45.45 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3622  YcfA family protein  45.45 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  42.11 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  38.33 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0601  YcfA family protein  46 
 
 		 56 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  38.98 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0047  YcfA family protein  37.93 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000425869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  36.84 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2607  YcfA family protein  37.7 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487609  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0137  YcfA family protein  37.7 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.010753  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  36.21 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  37.93 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4681  YcfA family protein  37.29 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  41.38 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  38.6 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  35.48 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>