55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2932 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  100 
 
 		 60 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  61.02 
 
 		 59 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  53.33 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  57.63 
 
 		 59 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  51.67 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  54.24 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  52.54 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  51.72 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  51.67 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  55.93 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  46.67 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  47.46 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  44.83 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  47.46 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  52.54 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1395  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2075  YcfA family protein  52.46 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  47.46 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  50.85 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2527  YcfA-like  48.28 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  50 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  49.21 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  50.85 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2674  YcfA family protein  46.67 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232678  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  44.83 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3307  hypothetical protein  45.31 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  48.89 
 
 		 54 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3438  YcfA family protein  45.31 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0971  hypothetical protein  45.31 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  40.35 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4319  YcfA-like  44.26 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  45.16 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  38.33 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  42.86 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  41.07 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  39.34 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3128  YcfA family protein  44.26 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.195816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  42.62 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  44.26 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2094  YcfA family protein  43.86 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.432616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0586  YcfA-like  42.62 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143835  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4059  YcfA family protein  46.43 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0047  YcfA family protein  42.86 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000425869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0601  YcfA family protein  42.31 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0043  hypothetical protein  45 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  35.59 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  38.98 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  35.59 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  39.66 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  41.82 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  28.81 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  33.33 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3343  YcfA family protein  42.11 
 
 		 62 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  decreased coverage  0.00934326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>