25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0137 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0137  YcfA family protein  100 
 
 		 69 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.010753  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2607  YcfA family protein  56.25 
 
 		 67 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487609  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0566  YcfA-like  48.21 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2666  YcfA family protein  47.46 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000153756  normal  0.80145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2884  YcfA family protein  52.5 
 
 		 54 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  45 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5078  hypothetical protein  50.85 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1739  hypothetical protein  42.11 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1017  YcfA family protein  40.98 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2273  YcfA family protein  45.9 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0172  YcfA family protein  40.35 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1325  YcfA family protein  40.35 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1838  hypothetical protein  39.71 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0035  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.151222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2252  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0757949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1451  YcfA family protein  37.7 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2771  YcfA family protein  40.62 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  42.59 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  38.6 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3658  YcfA family protein  40.32 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6578  YcfA family protein  38.6 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000196737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  31.67 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  36.51 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  36.51 
 
 		 74 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>