48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1240 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  100 
 
 		 74 aa  146  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  69.57 
 
 		 74 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  69.57 
 
 		 74 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  50.7 
 
 		 73 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2116  hypothetical protein  65.45 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  49.3 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  43.24 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  43.24 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  42.47 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  42.47 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  45.95 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  49.3 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  46.58 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  39.73 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  43.66 
 
 		 74 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2364  hypothetical protein  43.24 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404097  normal  0.0567112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  42.67 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  42.67 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  38.24 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  46.38 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  38.67 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  47.22 
 
 		 77 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  42.86 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1246  YcfA family protein  39.73 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  41.54 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  43.48 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  45.45 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  40.62 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  39.39 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1951  YcfA family protein  35.14 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.508484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1936  YcfA family protein  35.14 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.797457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  43.55 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0211  YcfA family protein  33.33 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  35.71 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2715  YcfA-like  37.68 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  31.58 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  42.62 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1661  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  42.62 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  36.36 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  31.58 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  36.84 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  37.84 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  35.44 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1137  YcfA family protein  35.71 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0318024  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  30.26 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  35.71 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>