22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2276 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  100 
 
 
79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  100 
 
 
79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0355  hypothetical protein  69.62 
 
 
80 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  68.35 
 
 
80 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1137  YcfA family protein  58.23 
 
 
80 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0318024  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0794  hypothetical protein  56.25 
 
 
82 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.331284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2582  hypothetical protein  44.3 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103745  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  46.77 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  46.77 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  41.94 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  41.67 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  42.62 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  38.18 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  38.18 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  37.1 
 
 
73 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  37.84 
 
 
73 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  40 
 
 
76 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  34.72 
 
 
74 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  37.1 
 
 
73 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  40 
 
 
76 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  32.81 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  42.62 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.417133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>