10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0701 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0701  YcfA family protein  100 
 
 		 83 aa  174  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00509047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0161  YcfA family protein  56.63 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0631  YcfA family protein  46.43 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3011  hypothetical protein  66.67 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  38.71 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  40.62 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  33.33 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  40.85 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0669  YcfA-like  41.27 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  37.1 
 
 		 73 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>