145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2665 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2665  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
168 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158616  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1989  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.94 
 
 
279 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46630  hypothetical protein  59.63 
 
 
278 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930854  hitchhiker  0.00000437655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4017  hypothetical protein  67.74 
 
 
278 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2363  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.67 
 
 
280 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.225365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  57.5 
 
 
280 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.23 
 
 
283 aa  97.1  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4439  PhzF family phenazine biosynthesis protein  64.1 
 
 
294 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.746932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3846  PhzF family phenazine biosynthesis protein  61.54 
 
 
291 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3119  phenazine biosynthesis protein PhzF family  61.54 
 
 
291 aa  95.9  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6782  putative phenazine biosynthesis protein  60.76 
 
 
278 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0835253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  58.9 
 
 
280 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0741  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50 
 
 
311 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.36 
 
 
276 aa  88.2  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4242  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  52.44 
 
 
331 aa  88.2  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  56 
 
 
285 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.13 
 
 
276 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.48 
 
 
283 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3886  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.5 
 
 
278 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3731  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50.6 
 
 
318 aa  84.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0400  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.28 
 
 
310 aa  84.3  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4074  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.75 
 
 
276 aa  84.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179647  normal  0.796679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  56.25 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1211  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.13 
 
 
296 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  71.7 
 
 
273 aa  81.3  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1408  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.64 
 
 
293 aa  80.5  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22670  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3334  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  43.36 
 
 
305 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5876  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.32 
 
 
279 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.201483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2536  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.44 
 
 
293 aa  77.8  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  65.38 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.29 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2222  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  43.12 
 
 
299 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.96967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5692  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.99 
 
 
293 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0707  putative phenazine biosynthesis protein phzF  43.12 
 
 
299 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2541  putative phenazine biosynthesis protein phzF  43.12 
 
 
299 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1152  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.12 
 
 
299 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2073  putative phenazine biosynthesis protein phzF  43.12 
 
 
299 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
276 aa  74.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.3632  normal  0.520518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0926  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.99 
 
 
293 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1312  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.12 
 
 
299 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.12 
 
 
299 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2119  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.82 
 
 
296 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.0423877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.34 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.44 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1741  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.06 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6090  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.91 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1987  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.91 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2353  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.06 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3018  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.25 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.37138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0592  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.95 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.06 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.81 
 
 
292 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.87 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6454  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.14 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0855729  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0949  phenazine biosynthesis protein phzF, putative  39.66 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0325  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.67 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00679482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.71 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1043  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.45 
 
 
278 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.760247  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1010  phenazine biosynthesis protein PhzF family  57.41 
 
 
290 aa  67.4  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0365  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.68 
 
 
279 aa  67.4  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1963  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  56.6 
 
 
239 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4322  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.67 
 
 
280 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.283976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  41.75 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1135  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.45 
 
 
289 aa  61.6  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  60.42 
 
 
291 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  54.17 
 
 
278 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  54.17 
 
 
278 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0718  PhzF family phenazine biosynthesis protein  52.63 
 
 
289 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  56.52 
 
 
278 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  56.52 
 
 
278 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  54.24 
 
 
296 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  52 
 
 
296 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  53.7 
 
 
289 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  53.7 
 
 
302 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  51.85 
 
 
286 aa  57.8  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  55.77 
 
 
309 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  55.77 
 
 
309 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  51.85 
 
 
288 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0956  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.77 
 
 
304 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1932  PhzF family phenazine biosynthesis protein  64.44 
 
 
305 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50 
 
 
307 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3592  phenazine biosynthesis protein PhzF family  51.85 
 
 
302 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  53.85 
 
 
309 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1009  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.86 
 
 
292 aa  54.7  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  54.72 
 
 
308 aa  54.3  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.55 
 
 
307 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2730  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.06 
 
 
303 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372142  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02007  phenazine biosynthesis PhzF family protein  52 
 
 
293 aa  52  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
308 aa  51.6  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2247  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.86 
 
 
287 aa  51.6  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
308 aa  51.6  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2476  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.17 
 
 
303 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  36 
 
 
301 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  36.78 
 
 
300 aa  50.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1440  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.02 
 
 
304 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.596759  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  32.58 
 
 
297 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.38 
 
 
305 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50 
 
 
288 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>