27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2041 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  59.1 
 
 		 607 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  100 
 
 		 1430 aa  2903    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  52.15 
 
 		 443 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  29.65 
 
 		 841 aa  309  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2235  hypothetical protein  46.75 
 
 		 368 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  34.55 
 
 		 635 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  31.81 
 
 		 617 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  46.89 
 
 		 821 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2236  hypothetical protein  27.78 
 
 		 757 aa  209  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.102893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1885  hypothetical protein  25.78 
 
 		 784 aa  180  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1729 aa  162  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  29.82 
 
 		 602 aa  159  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  26.2 
 
 		 811 aa  140  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  34.14 
 
 		 975 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0388  hypothetical protein  30.14 
 
 		 357 aa  120  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0421247  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  30.94 
 
 		 961 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1494  hypothetical protein  24.02 
 
 		 761 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.846046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  25.28 
 
 		 996 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  24.17 
 
 		 450 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1460  hypothetical protein  25 
 
 		 995 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  28.37 
 
 		 515 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  28.5 
 
 		 512 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  28.26 
 
 		 485 aa  55.5  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3830  hypothetical protein  22.65 
 
 		 943 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  25 
 
 		 487 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3070  hypothetical protein  26.64 
 
 		 355 aa  45.8  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  24.66 
 
 		 618 aa  46.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>