17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1884 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  100 
 
 		 821 aa  1691    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1430 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  30.77 
 
 		 841 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  42.86 
 
 		 443 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1729 aa  157  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1885  hypothetical protein  23.1 
 
 		 784 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2235  hypothetical protein  30.27 
 
 		 368 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0388  hypothetical protein  26.12 
 
 		 357 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0421247  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  27.48 
 
 		 811 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2236  hypothetical protein  28.71 
 
 		 757 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.102893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  28.28 
 
 		 975 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  27.33 
 
 		 961 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3830  hypothetical protein  26 
 
 		 943 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  28.51 
 
 		 996 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1460  hypothetical protein  23.49 
 
 		 995 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  28.1 
 
 		 450 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1494  hypothetical protein  27.57 
 
 		 761 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.846046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>