13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2236 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2236  hypothetical protein  100 
 
 		 757 aa  1555    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.102893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  60.42 
 
 		 1729 aa  918    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1885  hypothetical protein  29.15 
 
 		 784 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1494  hypothetical protein  27.15 
 
 		 761 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.846046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1430 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2235  hypothetical protein  34.93 
 
 		 368 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  29.89 
 
 		 443 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  28.71 
 
 		 821 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  22.32 
 
 		 811 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  26.19 
 
 		 841 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  24.53 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  23.31 
 
 		 961 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1460  hypothetical protein  20.67 
 
 		 995 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>