14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2233 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  902    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  52.15 
 
 		 1430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  42.86 
 
 		 821 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  37.88 
 
 		 841 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0388  hypothetical protein  31.44 
 
 		 357 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0421247  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  32.97 
 
 		 975 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  31.6 
 
 		 961 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2236  hypothetical protein  29.89 
 
 		 757 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.102893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  28.46 
 
 		 811 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1729 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  23.84 
 
 		 996 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1460  hypothetical protein  21.93 
 
 		 995 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3830  hypothetical protein  22.67 
 
 		 943 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1885  hypothetical protein  24.13 
 
 		 784 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.157419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>