11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1885 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1598    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1494  hypothetical protein  30.33 
 
 		 761 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.846046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2236  hypothetical protein  29.15 
 
 		 757 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.102893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1729 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1430 aa  180  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  23.1 
 
 		 821 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  21.14 
 
 		 811 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  24.2 
 
 		 841 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  24.13 
 
 		 443 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  31.53 
 
 		 450 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>