15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1493 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1716    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1430 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  30.77 
 
 		 821 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  37.88 
 
 		 443 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1729 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2235  hypothetical protein  28.86 
 
 		 368 aa  121  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  29.96 
 
 		 811 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  30.3 
 
 		 975 aa  94  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0388  hypothetical protein  29.18 
 
 		 357 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0421247  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  27.86 
 
 		 961 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2236  hypothetical protein  26.19 
 
 		 757 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.102893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  26.86 
 
 		 450 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1885  hypothetical protein  24.2 
 
 		 784 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1494  hypothetical protein  27.44 
 
 		 761 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.846046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  24.14 
 
 		 996 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>