12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0388 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  734    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0421247  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  30.67 
 
 		 811 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  31.44 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  26.12 
 
 		 821 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  30.04 
 
 		 975 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  29.18 
 
 		 841 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  26.87 
 
 		 961 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1460  hypothetical protein  25 
 
 		 995 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  24.24 
 
 		 996 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1729 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0555  hypothetical protein  22.43 
 
 		 494 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>