13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2237 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  100 
 
 		 996 aa  2033    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  53.47 
 
 		 1729 aa  991    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  35.06 
 
 		 961 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  30.92 
 
 		 975 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1460  hypothetical protein  25.63 
 
 		 995 aa  188  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3830  hypothetical protein  26.6 
 
 		 943 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1430 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0388  hypothetical protein  24.25 
 
 		 357 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0421247  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  28.51 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  23.84 
 
 		 443 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  25.57 
 
 		 811 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  23.98 
 
 		 841 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2235  hypothetical protein  29.03 
 
 		 368 aa  45.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>