14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1886 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  100 
 
 		 975 aa  2015    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  34.12 
 
 		 961 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1729 aa  364  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  30.76 
 
 		 996 aa  363  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1460  hypothetical protein  25.19 
 
 		 995 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3830  hypothetical protein  23.96 
 
 		 943 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  34.14 
 
 		 1430 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  32.97 
 
 		 443 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0388  hypothetical protein  30.04 
 
 		 357 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0421247  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  28.28 
 
 		 821 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  30.3 
 
 		 841 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  28.66 
 
 		 811 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2648  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1682 aa  46.6  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  27.32 
 
 		 450 aa  44.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>