15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3831 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  100 
 
 		 811 aa  1659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1430 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0388  hypothetical protein  30.67 
 
 		 357 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0421247  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  29.96 
 
 		 841 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  27.48 
 
 		 821 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  29.46 
 
 		 450 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1729 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  28.46 
 
 		 443 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2236  hypothetical protein  22.32 
 
 		 757 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.102893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  28.66 
 
 		 975 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1885  hypothetical protein  21.14 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2235  hypothetical protein  26.5 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  25.26 
 
 		 961 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1494  hypothetical protein  32.73 
 
 		 761 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.846046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  24.81 
 
 		 996 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>