11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0387 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  926    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  29.46 
 
 		 811 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  26.86 
 
 		 841 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1729 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1430 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2235  hypothetical protein  30.19 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2236  hypothetical protein  24.53 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.102893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  28.1 
 
 		 821 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1885  hypothetical protein  31.53 
 
 		 784 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  27.32 
 
 		 975 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3830  hypothetical protein  26.59 
 
 		 943 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>