11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2235 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2235  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  46.49 
 
 		 1430 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  34.14 
 
 		 1729 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2236  hypothetical protein  34.93 
 
 		 757 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.102893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1493  hypothetical protein  28.86 
 
 		 841 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  30.37 
 
 		 821 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1885  hypothetical protein  33.33 
 
 		 784 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1494  hypothetical protein  32.27 
 
 		 761 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.846046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3831  hypothetical protein  26.5 
 
 		 811 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.875037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  30.19 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  29.03 
 
 		 996 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>