10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3830 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3830  hypothetical protein  100 
 
 		 943 aa  1942    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1460  hypothetical protein  28.88 
 
 		 995 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1495  hypothetical protein  25.03 
 
 		 961 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2042  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1729 aa  200  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.291825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2237  hypothetical protein  26.6 
 
 		 996 aa  177  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1886  hypothetical protein  23.96 
 
 		 975 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0901144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1884  hypothetical protein  26 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248885  normal  0.648004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2233  hypothetical protein  22.67 
 
 		 443 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1430 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0387  hypothetical protein  26.59 
 
 		 450 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880342  normal  0.170023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>