12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3832 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1219    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  30.65 
 
 
635 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  29.48 
 
 
607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  29.8 
 
 
1430 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  28.12 
 
 
617 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  27.11 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  25.87 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3410  hypothetical protein  25.59 
 
 
877 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00835296  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  22.05 
 
 
512 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  26.61 
 
 
504 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  23.72 
 
 
487 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3070  hypothetical protein  28.31 
 
 
355 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>