13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1492 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1261    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  32.96 
 
 		 607 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1430 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  31.91 
 
 		 635 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  28.57 
 
 		 602 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  29.65 
 
 		 515 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  31.6 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  26.11 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3410  hypothetical protein  23.92 
 
 		 877 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00835296  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  29.35 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3070  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1171  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 888 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.527297  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1074  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 872 aa  43.9  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.834793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>