12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2232 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1228    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  59.1 
 
 
1430 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  35.53 
 
 
635 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  32.64 
 
 
617 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  29.32 
 
 
602 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  31.46 
 
 
515 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3410  hypothetical protein  24.14 
 
 
877 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00835296  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  28.57 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  28.86 
 
 
504 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  25.37 
 
 
485 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3070  hypothetical protein  25.31 
 
 
355 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  25.95 
 
 
618 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>