17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3826 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  976    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  34.86 
 
 		 487 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  32.91 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  33.58 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  31.71 
 
 		 504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  31.36 
 
 		 515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  26.01 
 
 		 609 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  26.2 
 
 		 602 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  27.49 
 
 		 635 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1492  hypothetical protein  29.35 
 
 		 617 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2224  hypothetical protein  25.98 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1430 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2232  hypothetical protein  25.37 
 
 		 607 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.603835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  24.15 
 
 		 618 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  26.45 
 
 		 669 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  25.97 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2013  hypothetical protein  32.56 
 
 		 220 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>