16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3409 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1236    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  35.4 
 
 		 539 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  28.42 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2013  hypothetical protein  30.91 
 
 		 220 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  26.01 
 
 		 485 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  25.97 
 
 		 669 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  26.72 
 
 		 488 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2224  hypothetical protein  25.12 
 
 		 667 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1462  hypothetical protein  25.09 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0152709  normal  0.836043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  25.8 
 
 		 692 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2012  hypothetical protein  32.76 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  24.84 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3410  hypothetical protein  26.09 
 
 		 877 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00835296  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  23.25 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3407  hypothetical protein  31.4 
 
 		 181 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109169  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  25.95 
 
 		 515 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>