13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2033 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  100 
 
 		 692 aa  1393    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  37.08 
 
 		 669 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1490  hypothetical protein  38.75 
 
 		 664 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1881  hypothetical protein  31.69 
 
 		 674 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.393635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1462  hypothetical protein  33.97 
 
 		 592 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0152709  normal  0.836043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2224  hypothetical protein  28.27 
 
 		 667 aa  114  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2898  hypothetical protein  23.77 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319126  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  24.92 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  28.14 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  25.8 
 
 		 609 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  26.19 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  27.48 
 
 		 487 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  23.54 
 
 		 539 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>